Если в договоре прописано что организация НЕ является налоговым агентом
Цена аренды в договоре -25 тр.
Перечисляется вам 25тр, вы сами считаете ндфл и платите его в налоговую.
По итогу года надо сдать декларацию 3-ндфл.
Если в договоре прописано что организация Является налоговым агентом
Цена аренды в договоре -25 тр.
Организация как налоговый агент вычтет из этой суммы 13% и остаток перечислит вам.
На руки получите 25000-13%=21750